Om de toekomst van de collectie en de tuin veilig te stellen is Pinetum Blijdenstein in 2000 ondergebracht in een zelfstandige stichting, Stichting Pinetum Blijdenstein. De stichting is gevestigd in Hilversum en is ingeschreven in het Handelsregister van de Kamer van Koophandel Gooi- en Eemland onder nummer 411 99 999.
Bestuur
Drs. Robbert Willink (voorzitter)
Prof. em. dr. Jan Stam (secretaris)
Dr. ir. Dennis R. Muntslag (penningmeester)
Prof. em. dr. Jan Wolf
Prof. dr. Peter Van Tienderen
Mw. Tanja Goderie
Drs. Sjirk Kok
Raad van advies
Dr. Z. Debreczy
M. Gardner MBE, VMM
Dr. I. Rácz
R. van Soldt
Dr. P. Knopf
Wetenschappelijk collectiebeheer
Dr. Rob Kruijt
Beheerder
Dhr. Hans Van Roon
De leden van het bestuur en de raad van advies ontvangen geen bezoldiging. Daarnaast zijn er nog ruim 40 mensen als vrijwilliger actief in de tuin, het bezoekerscentrum en voor andere functies.
